Protein–RNA interactions for Protein: O60256

PRPSAP2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPSAP2O60256 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPSAP2O60256 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPSAP2O60256 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPSAP2O60256 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPSAP2O60256 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPSAP2O60256 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPSAP2O60256 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPSAP2O60256 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPSAP2O60256 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPSAP2O60256 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPSAP2O60256 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms