Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PLIN1O60240 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PLIN1O60240 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PLIN1O60240 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PLIN1O60240 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PLIN1O60240 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PLIN1O60240 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms