Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSNA1O43805 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms