Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOCS1O15524 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms