Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC27A2O14975 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC27A2O14975 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A2O14975 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms