Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C0C1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C0C1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C0C1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C0C1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C0C1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C0C1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C0C1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C0C1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C0C1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C0C1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C0C1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C0C1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C0C1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C0C1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C0C1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C0C1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C0C1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0C1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0C1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0C1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0C1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0C1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0C1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H7C0C1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H7C0C1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H7C0C1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H7C0C1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H7C0C1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H7C0C1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H7C0C1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H7C0C1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H7C0C1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H7C0C1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H7C0C1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
H7C0C1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H7C0C1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H7C0C1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H7C0C1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H7C0C1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H7C0C1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H7C0C1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H7C0C1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H7C0C1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H7C0C1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H7C0C1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H7C0C1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
H7C0C1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H7C0C1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
H7C0C1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H7C0C1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H7C0C1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H7C0C1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H7C0C1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H7C0C1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H7C0C1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H7C0C1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H7C0C1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H7C0C1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
H7C0C1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H7C0C1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H7C0C1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H7C0C1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0C1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0C1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0C1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0C1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0C1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H7C0C1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
H7C0C1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H7C0C1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H7C0C1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H7C0C1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H7C0C1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H7C0C1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H7C0C1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H7C0C1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H7C0C1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H7C0C1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H7C0C1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H7C0C1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H7C0C1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
H7C0C1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H7C0C1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H7C0C1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H7C0C1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H7C0C1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H7C0C1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
H7C0C1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H7C0C1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H7C0C1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
H7C0C1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
H7C0C1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H7C0C1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H7C0C1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H7C0C1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H7C0C1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H7C0C1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H7C0C1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H7C0C1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms