Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB6E9PJ23 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms