Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP99D6REC4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms