Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCRIP1C9JLW8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCRIP1C9JLW8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCRIP1C9JLW8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCRIP1C9JLW8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCRIP1C9JLW8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCRIP1C9JLW8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCRIP1C9JLW8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCRIP1C9JLW8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCRIP1C9JLW8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCRIP1C9JLW8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCRIP1C9JLW8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCRIP1C9JLW8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MCRIP1C9JLW8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCRIP1C9JLW8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms