Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMCO5BA8MYB1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO5BA8MYB1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms