Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
A6NNZ2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A6NNZ2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A6NNZ2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A6NNZ2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A6NNZ2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A6NNZ2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
A6NNZ2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A6NNZ2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A6NNZ2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A6NNZ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A6NNZ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A6NNZ2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
A6NNZ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
A6NNZ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
A6NNZ2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
A6NNZ2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A6NNZ2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A6NNZ2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A6NNZ2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A6NNZ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A6NNZ2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A6NNZ2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A6NNZ2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A6NNZ2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
A6NNZ2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A6NNZ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
A6NNZ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A6NNZ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A6NNZ2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A6NNZ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A6NNZ2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A6NNZ2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A6NNZ2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A6NNZ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A6NNZ2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A6NNZ2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A6NNZ2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A6NNZ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A6NNZ2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A6NNZ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A6NNZ2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A6NNZ2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A6NNZ2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A6NNZ2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A6NNZ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
A6NNZ2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A6NNZ2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A6NNZ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A6NNZ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A6NNZ2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A6NNZ2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
A6NNZ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NNZ2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NNZ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NNZ2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NNZ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NNZ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NNZ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NNZ2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NNZ2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NNZ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NNZ2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NNZ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NNZ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A6NNZ2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A6NNZ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
A6NNZ2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A6NNZ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A6NNZ2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
A6NNZ2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A6NNZ2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A6NNZ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A6NNZ2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A6NNZ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A6NNZ2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A6NNZ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A6NNZ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A6NNZ2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A6NNZ2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A6NNZ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A6NNZ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A6NNZ2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A6NNZ2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A6NNZ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A6NNZ2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A6NNZ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NNZ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NNZ2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NNZ2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NNZ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NNZ2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NNZ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NNZ2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NNZ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
A6NNZ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A6NNZ2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A6NNZ2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A6NNZ2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NNZ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms