Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23AA6NH52 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TVP23AA6NH52 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms