Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC78A2IDD5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC78A2IDD5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms