Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RR11

CENPVL1, Centromere protein V-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL1A0A0U1RR11 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPVL1A0A0U1RR11 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1574.9 ms