Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX9Q9Y5X1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms