Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms