Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms