Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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