Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms