Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms