Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms