Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms