Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms