Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms