Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms