Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms