Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms