Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms