Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms