Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms