Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms