Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSX2Q9BZM3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms