Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BARHL1Q9BZE3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms