Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PI4K2AQ9BTU6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms