Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms