Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms