Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms