Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNS3Q9BQ31 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms