Protein–RNA interactions for Protein: Q99502

EYA1, Eyes absent homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA1Q99502 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA1Q99502 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA1Q99502 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms