Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms