Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms