Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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