Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms