Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms