Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms