Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms