Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRG4Q92954 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms