Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms