Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms