Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms